Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F8VP50 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
F8VP50 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
F8VP50 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F8VP50 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F8VP50 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F8VP50 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
F8VP50 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
F8VP50 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F8VP50 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F8VP50 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F8VP50 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F8VP50 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F8VP50 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F8VP50 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F8VP50 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F8VP50 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F8VP50 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F8VP50 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F8VP50 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F8VP50 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F8VP50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F8VP50 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F8VP50 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F8VP50 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F8VP50 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F8VP50 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F8VP50 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F8VP50 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F8VP50 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F8VP50 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F8VP50 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F8VP50 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F8VP50 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F8VP50 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
F8VP50 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F8VP50 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F8VP50 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F8VP50 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F8VP50 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F8VP50 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
F8VP50 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
F8VP50 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
F8VP50 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F8VP50 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F8VP50 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F8VP50 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
F8VP50 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8VP50 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F8VP50 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F8VP50 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F8VP50 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F8VP50 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F8VP50 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F8VP50 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
F8VP50 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F8VP50 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F8VP50 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F8VP50 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F8VP50 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
F8VP50 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F8VP50 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F8VP50 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8VP50 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
F8VP50 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8VP50 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8VP50 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8VP50 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8VP50 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8VP50 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8VP50 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VP50 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VP50 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VP50 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VP50 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
F8VP50 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VP50 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VP50 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VP50 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VP50 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VP50 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms