Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN25C9JDP6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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