Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9J4A7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9J4A7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9J4A7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9J4A7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9J4A7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9J4A7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9J4A7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9J4A7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9J4A7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9J4A7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9J4A7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9J4A7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9J4A7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9J4A7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9J4A7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9J4A7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9J4A7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9J4A7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9J4A7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9J4A7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9J4A7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9J4A7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C9J4A7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9J4A7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9J4A7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9J4A7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9J4A7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9J4A7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9J4A7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C9J4A7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9J4A7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9J4A7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9J4A7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9J4A7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9J4A7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9J4A7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9J4A7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9J4A7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9J4A7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9J4A7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C9J4A7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9J4A7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9J4A7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9J4A7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9J4A7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C9J4A7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9J4A7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9J4A7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9J4A7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9J4A7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9J4A7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9J4A7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9J4A7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9J4A7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9J4A7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9J4A7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9J4A7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9J4A7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms