Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf58C9J3I9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf58C9J3I9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms