Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms