Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO5BA8MYB1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO5BA8MYB1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms