Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KNCNA6PVL3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNCNA6PVL3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms