Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NNZ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NNZ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A6NNZ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A6NNZ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A6NNZ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A6NNZ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A6NNZ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A6NNZ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
A6NNZ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NNZ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NNZ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NNZ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NNZ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NNZ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NNZ2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NNZ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NNZ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NNZ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A6NNZ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A6NNZ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A6NNZ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A6NNZ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A6NNZ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NNZ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NNZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A6NNZ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A6NNZ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A6NNZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A6NNZ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A6NNZ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A6NNZ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A6NNZ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A6NNZ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A6NNZ2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NNZ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A6NNZ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
A6NNZ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A6NNZ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A6NNZ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A6NNZ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A6NNZ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A6NNZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A6NNZ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NNZ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NNZ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NNZ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NNZ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NNZ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NNZ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NNZ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NNZ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NNZ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A6NNZ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A6NNZ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A6NNZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A6NNZ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A6NNZ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A6NNZ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A6NNZ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A6NNZ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A6NNZ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A6NNZ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms