Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP27XA6NNY8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms