Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf60A6NFR6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms