Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NBASA2RRP1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBASA2RRP1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBASA2RRP1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms