Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA6A0AVT1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms