Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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