Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RQF3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQF3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQF3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms