Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms