Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms