Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX6Q9UNH7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX6Q9UNH7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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