Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRTO4Q9UKD2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms