Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MID2Q9UJV3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MID2Q9UJV3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms