Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RABGEF1Q9UJ41 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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RABGEF1Q9UJ41 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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RABGEF1Q9UJ41 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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RABGEF1Q9UJ41 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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RABGEF1Q9UJ41 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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RABGEF1Q9UJ41 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1Q9UJ41 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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