Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms