Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHORDC1Q9UHD1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms