Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms