Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms