Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM4Q9C037 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms