Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
YTHDF1Q9BYJ9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms