Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms