Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms