Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms