Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms