Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms