Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms