Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LCN9Q8WX39 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms