Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms