Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF148Q8N7C7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms