Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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TMCO5AQ8N6Q1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TMCO5AQ8N6Q1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TMCO5AQ8N6Q1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TMCO5AQ8N6Q1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TMCO5AQ8N6Q1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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