Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SYT9Q86SS6 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms