Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CATSPER4Q7RTX7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms