Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms