Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBLN3Q6UW01 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBLN3Q6UW01 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CBLN3Q6UW01 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms