Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms