Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUX4L9Q6RFH8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms