Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms