Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDK2Q58EX2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms