Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms