Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms