Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms