Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRNQ16849 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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