Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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