Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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